股票类基金也不例外。其中直接受影响的可能要算直接投资于如银行、建筑、建材类股票的基金。在美国668只交易所交易基金（ETF）里，名列亏损前茅的20只ETF里就有15只与金融和房产有关；金融类占10只，而排名亏损第一、二位则由房屋建筑类囊括。首当其冲是iShare道琼斯住宅建筑ETF。基金在第一季度才亏损19%，但截至11月30日，亏损已扩大至59%。紧跟其后的则是亏损49%的SPDR标普建筑商基金。
在晨星18个美国本土股票型基金分类里，金融和房产类基金表现最差，平均收益出现10%的亏损。596只金融和房产类基金里，今年以来亏损达到10%以上的基金占总数的52%。今年第一季度亏损就达到7%的富达房屋融资精选基金和FBR小盘金融业基金，截至11月底亏损已分别扩大至35%和22%。其中富达房屋融资精选基金仍处于亏损首位。在亏损20%以上的列表里也出现了ProFunds金融基金和地产和富兰克林系列基金。他们在第一季表现中并没有出现大量亏损，ProFunds终极房产服务和投资基金尚有2%的收益。
不仅仅是行业类基金受影响，一些综合性基金也受困。如价值型投资的传奇人物韦利·维茨（Wally Weitz）就持有相关股票。在他管理的5只基金——Hickory基金、维茨价值基金、维茨伙伴基金、维茨伙伴价值基金和维茨伙伴三号机遇基金，其组合均拥有5%以上的资产投资在今年亏损78%的全美金融公司（CFC）上。其中Hickory基金和维茨伙伴三号机遇基金均出现双位数的亏损。
但另一方面，一些基金却受惠于次贷危机所带来的投资机会。他们大部分都持有了做空证券。如CGM Focus基金今年来将近70%的回报就得益于持有卖空全美金融公司的头寸。并使其位居大盘混合型基金的榜首。与其相类似的长叶伙伴国际基金和长叶伙伴小盘基金今年回报率都在各自的晨星类别处于前10名，得益于今年股价已上涨52%的费尔法克斯金融公司。
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